MS-06R-1型整体性能不错，但火箭推进器系统却故障率太高，于是在吉恩尼克开发部门和吉恩军方的调节下使用了竞争对手兹玛德公司的推进器系统，解决了故障率过高的问题，另外还将R-1型的燃料舱小型化，改为弹筒式，并对脚部机构进行了革新设计，发展成MS-06R-1A，使机体外形更紧凑，性能大为提高。尤其是整备性能比1型优良很多，更利于前线作战需要。
         MS-06R-1A型整体性能很让人满意，尤其是许多王牌机师非常青睐，但它继承了R系列对驾驶操作要求高的特点，在前线甚至有“只有王牌才有资格驾驶MS-06R-1A”的传言。
         宇宙降下作战后，吉恩军成功占领了具有丰富生产力的敖德萨和加利福利亚地区，生产力大幅加强，扎古J型等陆战机型转由地面生产。于是月面基地格拉那达生产线开始量产R-1A型，从79年6月开始共生产了56架，并由MS-06R-1型改造了10余架，共70余架（也有共80余架一说），成为R系列中量数最高的机型。